土木營建為國家建設之根本工程，環境保育則是維持國家永續經營發展之基礎學門；有鑒於科技發展一日千里，高等人才的訓練將不再只侷限於特定領域，藉由跨學門的整合將可訓練出有別於傳統且具有新思維的高等人材，在此前瞻之思維與時代之需求下，本系(所)為全國首創整合土木與環境工程兩大學門的學系，期望培育出不僅具備專業的工程能力且兼具環保永續發展觀念之新一代工程師，並達成下列目標：

1. 配合國家經建發展需要，培育高級科技工程人才。

2. 因應地域性重要科技產業規劃，均衡區域發展，推動產業技術升級。

3. 建立跨領域學門整合之典範，提供畢業生及在職專業人士完整的進修管道。

4. 增進產學合作關係，整合既有資源，發揮專業學程特色，充分結合理論與實務。